真言宗の古刹で、行基の創建と伝えられる。往古は洞泉山真長寺と称していたが、天文4年（1535年）近松光保の弟、吽阿上人が再興して三輪山真長寺と改めた。
　本尊の釈迦如来坐像は、国指定重要文化財に指定されており、像高2.82ｍ、光背3.21ｍ、台座84.8ｃｍで桂材の寄木造りで、表面に厚く漆がかけてあり、藤原時代の作である。
　また、石庭は岐阜市指定名勝となっている。